1.松谷蹄盖蕨 Athyrium.vidalii(Franch.et Sav.)Nakai var.amabile (Ching)Z.R.Wang
2.天目山铁角蕨 Asplenium.tianmushanense Ching.
3.假长尾复叶耳蕨 Arachniodes.pseudo-simplicior Ching
4.阔鳞鳞毛蕨 Dryopteris championii(Benth.)C.Chr.ex Ching(D.conferta Ching et Chiu)
5.高鳞毛蕨 D.simasakii(H.Ito)Kurata(D.laodianensis Ching et Chiu)
6.黑足鳞毛蕨 D.fuscipes C.Chr(D.neofuscipes Ching et Chiu)
7.宽鳞耳蕨 Polystichum .latilepis Ching et H.S.Kung
8.天目金粟兰 Chloranthus tienmushanensis K .F. Wu
9.银叶柳 Salix . chienii Cheng
10.湖北鹅耳枥 Carpinus hupeana Hu(C.huana Cheng)
11.天目铁木 Ostrya rehderiana Chun
12.天目朴 Celtis . chekiangensis Cheng 
13.浙江蝎子草 Girardinia chingiana Chien
14.细穗藜 Chenopodium gracilispicum Kung
15.日本商陆Phytolaccajaponica Makino(P. zhejiangensis W. T. Fan)
16.六角莲 Dysosma pleiantha (Hance) Woods.(Podophyllyum chengii Chien)
17.天目木兰 Magnolia amoena Cheng
18.二色五味子 Schisandra repanda (Sieb. et Zucc.) Radlk. (S. bicolor Cheng)
19.天目木姜子 Litsea auriculata Chien et Cheng
20.白花土元胡 Corydalis . humosa Migo
21.浙江碎米荠 Cardamine. zhejiangensis T.Y.Cheo et R. C. Fang
22.山萮菜 Eutrema yunnanense Franch.（E.reflexa T.Y.Cheo）
23.天目山景天 Sedum  tianmushanense Y. C. Ho   
24.绿花茶麃 R. viridiflorum (Cheng) L. T. Lu et K.Yao (R. tenue Janz. var. viridiflorum Cheng )
25.无腺橉木 Padus brachypoda (Batal.) Schneid.var. eglandulosa (Cheng) H.J.Wang (Prunus brachypoda Batal. var. eglandulosa Cheng)
26.迎春樱 Cerasus discoidea Yu et Li (Prunus discoidea (Yu et Li) Yu et Li)
27.天目绣线菊 Spiraea blumei G. Don var. pubicarpa Cheng
28.无翅大叶胡枝子 Lespedeza davidii Franch.var.exalata L.H.Lou
29.短蕊槐 Sophora brachygyna C.Y. Ma  
30.锐角槭 Acer acutum Fang
31.临安槭 A. linganense Fang et P.L.Chin ex Fang  
32.卷毛长柄槭 A. longipes Franch. ex Rehd. var. pubigerum (Fang) Fang   
33.弯翅色木槭 A. mono Maxim var. incurvatum Fang et P.L.Chiu ex Fang
34.橄榄槭 A. olivaceum Fang et P. L. Chiu ex Fang
35.毛鸡爪槭 A. pubipalmatus Fang  
36.天目槭 A. sinopurpurascens Cheng 
37.羊角槭 A. yangjuechi Fang et P. L. Chiu ex Fang 
38.天目山凤仙花 Impatiens. tienmushanica Y. L. Chen  
39.腋毛勾儿茶 Berchemia barbigera C. Y. Wu ex Y. L. Chen  
40.脱毛大叶勾儿茶 B. huana Rehd var. glabrescens Cheng ex Y. L.Chen  
41.大籽猕猴桃 Actinidia . macrosperma C.F.Liang  
42.黑蕊猕猴桃 A. melanandra Franch.(A.viridiflava P.S.Hsu)
43.短萼紫茎 Stewartia sinensis Rehd. et Wils .var brevicalyx (S.Z.Yan)Ming ex J.Li (S brevicalyx Yang )
44.天目紫茎 S. gemmata Chien et Cheng (S. sinensis auct.non Rehd. et Wils.)  
45.毛梗心叶堇菜 Viola  concoidefolia W. Becker  var. hirtipedicellata C. J. Wang 
46.天目瑞香 Daphne grueningiana H.Winkl
47.光荛花 Wikstroemia glabra Cheng
48.细刺五加 Acanthopanax  setulosus Franch. (A. zhejiangensis X. J. Xue et S. T. Fang)
49.天目当归 Angelica. tianmuensis Z.H.Pan et T.D.Zhuang (A. polymorpha auct. non Maxim.)
50.南方大叶柴胡 Bupleurum  longiradiatum Turcz. f. australe Shan et Y. Li
51.天目变豆菜 Sanicula tienmuensis Shan et Constance 
52.长梗过路黄 Lysimachia longipes Hemsl.（Lysimachia longipes Hemsl.f.simplicicaulisChien）
53.天目珍珠菜 L. tienmushanensis Migo
54.祛风藤 Biondia microcentrum (Tsiang) P.T.Li (Adelostemma microcentrum Tsiang)
55.贵州娃儿藤 Tylophora silvestris Tsiang(Biondia henryi Tsiang et P.T.Li var.longipedunculata M.Cheng et Z.Y.Feng)
56.浙赣车前紫草 Sinojohstonia chekiangensis (Migo) W. T. Wang
57.绒毛绵穗苏 Comanthosphace ningpoensis (Hemsl.) H.-M var.stellipiloides C.Y.Wu
58.舌瓣鼠尾草Salvia liguliloba Sun
59.拟丹参 S.sinica Migo
60.天目地黄 Rehmannia chingii H. L. Li
61.黄筒花 Phacellanthus tubiflorus Sieb. et Zucc. (Tienmuia triandra Hu)
62.天目山蓝 Peristrophe. tianmuensis H.S.Lo
63.壮大聚花荚蒾 Viburnum glomeratum Maxim. ssp. magnificum (Hsu) Hsu
64.沟核茶荚蒾 Viburnum setigerum Hance var. sulcatum Hsu
65.斑花败酱 Patrinia punctiflora Hsu et H. J. Wang
66.大斑花败酱 P. punctiflora Hsu et H. J. Wang var. robusta Hsu et H. J. Wang
67.天目续断 Dipsacus tianmuensis C. T. Cheng et Z. T. Yin
68.天目雪胆 Hemsleya graciliflora (Harms) Cogn var. tianmuensis  X.J.Xue et H.Yao
69.密毛奇蒿 Artemisia anomala A.Moore var. tomentella Hand.-Mazz
70.宽叶山蒿 A. stolonifera (Maxim.) Kom.(A.migoana Kitamura)
71.杭蓟 Cirsium tianmushanicum Shih
72.浙江橐吾 Ligularia chekiangensis Kitam.
73.假福王草 Paraprenanthes sororia (Miq.) Shih (Lactuca sororia Miq.)
74.天目山蟹甲草  Parasenecio matsudai (Kitam.) Y.L.Chen (C. rubescens auct .non (S.Moore) Matsuda)
75.庐山风毛菊 Saussurea. bullockii Dunn (S. teinmushanensis Chen)
76.天目隐子草 Cleistogenes ramiflora Keng et C.P.Wang var. tianmushanensis F. Z. Li et C. K. Ni
77.阔叶箬竹 Indocalamus latifolius (Keng) McClure(Sasamorpha migoi Nakai)
78.浙江柳叶箬 Isachne hoi Keng f.
79.华箬竹 Sasa sinica Keng
80.光叶华箬竹Sasa sinica(Keng)Koidz.f.glabra C.H.Hu
81.天目贝母 Fritillaria monantha Migo
82.粗壮小鸢尾 Iris proantha Diels var. valida (Chien) Y. T. Zhao
83.无距虾脊兰 Calanthe tsoongiana Tang et Wang
84.扇脉杓兰 Cypripedium japonicum Thunb.
85.长唇羊耳蒜 Liparis pauliana H.-M.（L.cucullata Chien）
86.象鼻兰 N othodoritis zhejiangensis Tsi
87.长叶山兰 Oreorchis fargesii Finet(O.intermedia Chien)